最高の無料オンライン系統樹作成サービスのリストです。 系統樹は、さまざまな種間の進化的関係を際立たせる木の一種です。また、ある種が別の種から分岐していることも強調しています。さまざまなゲノムおよび遺伝子データ配列データを使用して系統樹を作成する場合は、これらのオンライン系統樹作成サービスを使用できます。これらのサービスはすべて無料で使用でき、どこからでもアクセスできます。
これらのサービスでは、ユーザーは種のゲノム データを Newick、Nexus、FASTA、EMBL などのファイル形式で入力できます。ユーザーは、種のゲノム データをこれらのサービスに直接貼り付けて、系統樹を生成することもできます。生成されたツリーでは、エッジ、ノード、種名などを表示できます。いくつかのサービスでは、カラー コードを使用してツリーのさまざまな要素を区別しています。一部のサービスを通じて、ユーザーはまた、円形、長方形、無根など、さまざまな種類のツリーを生成します。これに加えて、ユーザーは、表示、分析、、注釈を行うためのツールも取得します。 > 系統樹。系統樹を生成するプロセスも、これらすべてのサービスで非常に簡単です。
系統樹を表示して分析した後、ユーザーはそれを PDF、SVG、EPS、 などのファイル形式で保存またはエクスポートできます。これらのサービスの詳細については、リストを参照してください。
お気に入りの系統樹作成サービス:
phyloT は、さまざまな種類のゲノム データとゲノム データ ファイルを使用して系統樹を生成できるので、私のお気に入りのサービスです。さらに、ユーザーは生成された系統樹に注釈を付けることができます。
phyloT
phyloT は無料のオンライン系統樹作成サービスです。このサービスは、NCBI タクソノミまたはゲノム タクソノミ データベースに基づいています。このサービスを使用すると、Newick、Nexus、、または phyloXML ファイルにある分類データを使用して、系統樹を簡単に生成および分析できます。系統樹を生成する前に、ユーザーはノード識別子タイプ (学名、NCBI 分類 ID など)、内部ノード (折りたたみまたは展開)、 を指定することもできます。中断 (種、クラス、順序、中断なしなど) など。すべてのパラメータを指定した後、ユーザーは系統樹を生成できます。次に、このオンライン サービスの主な機能を確認してください。
主な機能:
- ツリー モード: このオンライン サービスでは、円形、長方形、無根の 3 種類の系統樹を生成できます。
- Manual Annotations: ツリーに手動で注釈を付け、既存の情報を編集することも含まれます。
- ツリー調整ツール: 系統樹を生成した後、拡大、ツリーの回転、ラベルの変更、種名のフォント スタイルの変更、色の範囲の調整を行うことができます。
- 高度なツール: これを使用して、ユーザーはブランチ メタデータの表示、ノード オプション、およびルート ツリーの中間点を有効または無効にできます。
- エクスポート: 生成された系統樹 SVG、EPS、PDF、PNG、 および テキスト (Newick Tree、PhyloXML ファイルなど) ファイル形式。
最終的な考え:
系統樹を簡単に生成、分析、注釈付けできる機能豊富なオンライン系統樹メーカー サービスです。
系統発生
phylogeny は、もう 1 つの無料のオンライン系統樹メーカー サービスです。このオンライン サービスを通じて、ユーザーは詳細な系統樹のレンダリングを生成できます。系統樹を生成するには、ユーザーは FASTA、EMBL、 または NEXUS ファイル形式の形式で 配列データのセット を入力する必要があります。ユーザーは、このサービスのデータ フィールドにフォーマットされたシーケンス データのセットを入力または貼り付けることもできます。データまたはファイルを入力した後、ユーザーは [送信] ボタンをクリックして系統樹を生成および表示する必要があります。次に、このオンライン サービスの主な機能を確認してください。
主な機能:
- 概要>: 系統樹を生成するプロセスを強調した図を示します。このプロセスには、ユーザー入力、アライメント、キュレーション、系統発生、ツリー レンダリングが含まれます。
- 配置: BLOSUM62 スコアを使用して、一連のデータをさまざまな色で強調表示します。
- キュレーション: 配列数、想定されるアラインメント、新しい位置数、アラインメント ブロック、隣接位置など、さまざまなキュレーション結果が表示されます。リ>
- 系統発生: レンダリングなしで系統樹図を表示します。
- ツリー レンダリング: シーケンス エッジとノードを含むレンダリングされた系統樹図を示します。
- アクション: このサービスでは、ユーザーは、中点発根、枝の折りたたみ、スワップ、フリップなどのアクションを使用して、レンダリングされた系統樹にさまざまな変更を加えることもできます。
- ツリー スタイル: 系統発生 t をレンダリングした後ユーザーは、フィログラム、クラドグラム、放射状、円形などのスタイルを変更できます。
- ツリーをダウンロード: PNG、PDF、SVG、TGF、Newick、および TXT ファイルで最終的な系統樹をダウンロードするために使用します
最終的な考え:
これは、ユーザーがさまざまな種類の詳細でレンダリングされた系統樹を生成できる、もう 1 つの優れたオンライン系統樹メーカー サービスです。
ETEToolkit
<強い>ETEToolkit は、もう 1 つの無料のオンライン系統樹メーカー サービスです。このサービスは、Newick および Fasta ファイルまたはデータを使用して系統樹を生成できます。また、ユーザーがテスト系統樹を生成できる組み込みのサンプルデータも付属しています。それでは、この系統樹メーカー サービスの主な機能を確認してください。
主な機能:
- View Tree: このサービスに配列データまたはファイルを入力した後、View tree ボタンを押して系統樹の生成を開始します。
- 色分けされたツリー: このサービスによって生成された系統樹では、さまざまなツリー ノードと要素が固有の色で強調表示されます。
- アラインメント画像タイプ: これを使用すると、ユーザーは アライン ブロック形式、圧縮形式、および アラインメント形式なし で系統樹を生成できます。
- 共有: このサービスはパーマリンクを生成しますユーザーが他のユーザーと共有できる系統樹。
追加機能:
- このサービスは、系統発生ツール インデックス、系統発生ツール クックブック、Python API リファレンスなどの追加ツールも提供します。
最終的な考え:
これは、ユーザーが Newick および Fasta 形式のデータを使用して系統樹をすばやく作成および分析できる、もう 1 つの優れたオンライン系統樹メーカー サービスです。
Creately.com
Creately.com は、もう 1 つの無料のオンライン系統図です。neticツリーメーカーサービス。単純な系統樹の作成にも使用できる、標準的なチャートおよびダイアグラム作成サービスです。他のほとんどの同様のサービスとは異なり、ゲノムとデータ シーケンスを使用して系統樹を作成することはできません。このサービスを使用して系統樹を生成するには、図形、接続線、チャート ブロックなどの標準的な図要素を手動で使用して、系統樹を作成する必要があります。次に、このオンライン サービスの主な機能を確認してください。
主な機能:
- 図形: このセクションには、系統樹やその他の種類の木を簡単に作成するためのすべての図形と接続要素が含まれています。提供される形状要素には、角丸長方形、円、三角形、直角三角形、八角形、円錐、立方体、線などがあります。形状に加えて、系統樹のノードとエッジに名前を付けるためのテキスト ツールも提供します。
- テンプレート: このサービスce には、ネットワーク ダイアグラム、GCP ダイアグラム、ガント チャート、コンセプト マップなど、さまざまなタイプのダイアグラムのテンプレートが付属しています。ユーザーは、利用可能なテンプレートを使用および変更して、それらを系統樹に変換することもできます。
- エクスポート: 最終ツリーを PNG、SVG、JPEG、、および PDF ファイル形式でエクスポートするために使用します。
制限:
- このオンライン サービスの無料版では、基本的な形状、限定されたドキュメント、および限定されたコラボレーション ツールが提供されます。さらに、ネイティブの系統樹メーカーではありません。
最終的な考え:
これは、ユーザーが系統樹やさまざまな種類の図を作成できる、優れたオンライン系統樹メーカー サービスです。